用作肥料是雞糞最主要的用途，目前應用大約占到雞糞總量的95％以上。雞糞中富含氮、磷、鉀等植物所必需的養分，是植物生產中優質的有機肥，優于其他畜禽糞肥。從測定結果看，雞糞中氮磷鉀三元素的含量都是比較高的。而且經過干燥處理后的雞糞松軟、無臭味，不帶病原微生物，可以廣泛用于花卉種植和無土栽培中。當今，在發達國家和地區提倡“有機農業”生產，其中重要的內容之一就是利用有機肥代替化肥，經過無害化處理的雞糞完全能夠滿足這種需要。據中國農業科學院(1991)的實驗，施用烘干雞糞的番茄、黃瓜等蔬菜，其畝產量明顯高于施用蛭石混合肥和復合營養液的對照組；瓜菜中可溶性固形物、糖、酸和維生素c的含量較大提高；單位產量的成本明顯下降。
 在目前我國大力發展“綠色食品”生產的情況下，烘干雞糞的用途會更廣泛，在調查中我們了解到，上述幾個企業的烘干雞糞不僅已在當地應用，還銷往鄭州郊區、新鄉郊區以及山東、安徽等地。